Novi Meksiko je jedan od najvećih proizvođača čili paprike (Capsicum spp.) u Sjedinjenim Državama, sa 51,000 tona proizvodnje u 2021. sa površine od 8500 hektara sa prosječnom produktivnošću od 6 tona/jutar prema podacima američkog Ministarstva poljoprivrede National Služba za statistiku poljoprivrede. Prosječna produktivnost smanjena je za 25% jer je površina zasađena za proizvodnju čili paprike ostala ista. To je rezultiralo smanjenjem privredne aktivnosti od skoro 10% u 2020. u odnosu na prethodnu godinu, sa 50.1 milion dolara na 44.9 miliona dolara. Ovaj značajan pad u ukupnoj proizvodnji čili paprike u državi podstakao je naučnike na nove napore modernizacije usmjerene na ubrzavanje genetskog dobitka i poboljšanje produktivnosti u NMSU Chile Pepper Breeding and Genetics programu procjenom različitih osobina povezanih s prinosom i potencijalom prinosa koristeći visoko- alati za fenotipizaciju protoka kao što je Tomato Analyzer (TA).
Arhitektura voća i osobine vezane za morfologiju su među determinantama raznolikosti voća i glavni su doprinosi prinosu i potencijalu prinosa čili paprike. Koristeći softver TA, naučnici su prikupili podatke o skupu atributa voća, uključujući perimetar ploda, indekse oblika, veličinu i asimetriju u kolekciji različitih linija čili paprike procijenjenih u uslovima uzgoja u Novom Meksiku.
Istraživači su imali za cilj da okarakterišu 105 genotipova panela raznolikosti Capsicum koji se sastoji od sorti, uzgojnih linija, landrasa i divlje vrste pripada 12 različitih vrsta mahuna (voća), za 32 morfometrijska TA deskriptora. Hijerarhijska analiza klastera grupirala je genotipove u osam klastera na osnovu TA deskriptora. Osnovna mjerenja – naime, obim, površina, širina srednja visina, maksimalna širina, visina srednja širina, maksimalna visina, i zakrivljena visina— bili su najdiskriminatorniji deskriptori sa maksimalnim doprinosom ukupnom obliku ploda.
Pokazana je korisnost morfometrijskih TA deskriptora, koje je teško izmjeriti konvencionalnom fenotipizacijom. Nekoliko sorti sa željenim oblikom i morfologijom ploda na osnovu klaster analiza preporučeno je kao roditeljske linije za hibridizaciju radi poboljšanja prinosa u programima oplemenjivanja čili paprike. Rezultati koji koriste TA za mjerenje svojstava vezanih za voće će pružiti osnovu za studija povezanosti u genomu i genomska selekcija za prinos i osobine koje doprinose prinosu u novomeksičkoj čili paprici.